20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_52000 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_52000  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  274  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4561  hypothetical protein  93.53 
 
 		 139 aa  263  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.672359  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2991  membrane protein-like protein  63.77 
 
 		 136 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4230  hypothetical protein  55.07 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318595  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4074  hypothetical protein  58.7 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1643  hypothetical protein  58.7 
 
 		 137 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1205  hypothetical protein  56.52 
 
 		 137 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1245  hypothetical protein  57.25 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000160953 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36840  hypothetical protein  62.32 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.693285  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2248  putative transmembrane protein  45.83 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02145  hypothetical protein  32.73 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123559  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0898  translation elongation factor Tu  32.39 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000668063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2990  membrane protein-like  33.03 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1557  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1829  membrane protein-like  32.76 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  35.34 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1980  hypothetical protein  33.62 
 
 		 115 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  30.17 
 
 		 135 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1199  membrane protein-like protein  32.28 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.553066  normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1118  membrane protein-like protein  32.28 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>