10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_28560 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_28560  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  342  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2491  hypothetical protein  86.13 
 
 		 173 aa  295  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  38.41 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  29.36 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  25.64 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  30.56 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  28.57 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  29.86 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  30.37 
 
 		 175 aa  40.8  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  25.16 
 
 		 271 aa  40.8  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>