24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4346 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4346  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  662    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1592  hypothetical protein  27.93 
 
 		 327 aa  79  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2072  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.64 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34590  hypothetical protein  25.59 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.911708  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2382  hypothetical protein  23.42 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374841  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1892  hypothetical protein  23.91 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664815  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1044  hypothetical protein  23.22 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5259  nutrient deprivation-induced protein  23.27 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3868  hypothetical protein  24.55 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.407065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4816  hypothetical protein  34.58 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5622  nutrient deprivation-induced protein  22.65 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.227691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7554  hypothetical protein  30.61 
 
 		 133 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0154653  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3143  hypothetical protein  26.85 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4598  hypothetical protein  26.67 
 
 		 260 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0738  hypothetical protein  30.77 
 
 		 455 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1832  hypothetical protein  34.41 
 
 		 128 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1553  hypothetical protein  34.41 
 
 		 128 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1688  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6819  hypothetical protein  30.61 
 
 		 133 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1482  hypothetical protein  36.47 
 
 		 126 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263136 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3899  putative nutrient deprivation-induced protein  25.57 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2258  hypothetical protein  26.09 
 
 		 275 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.601057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1248  hypothetical protein  26.32 
 
 		 241 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6818  hypothetical protein  28.12 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>