35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4037 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4037  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  172  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.649084  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2705  hypothetical protein  40.35 
 
 
77 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328169  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1478  hypothetical protein  35.29 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311784  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0222  hypothetical protein  40.91 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0231987  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2917  hypothetical protein  36.51 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.37466 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2241  hypothetical protein  43.86 
 
 
83 aa  50.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.778547 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3078  hypothetical protein  37.7 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2684  hypothetical protein  37.7 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1190  hypothetical protein  41.38 
 
 
64 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21011  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0981  hypothetical protein  38.98 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.995934  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2585  hypothetical protein  45 
 
 
65 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246477 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2490  hypothetical protein  35.71 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.461455  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3689  hypothetical protein  43.33 
 
 
67 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188444  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2751  hypothetical protein  35.94 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3417  hypothetical protein  35.94 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0064901  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2965  hypothetical protein  40 
 
 
64 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.568379 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2258  hypothetical protein  32.31 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000331337  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2478  hypothetical protein  42.37 
 
 
61 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.328506  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0336  hypothetical protein  41.38 
 
 
62 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0204  hypothetical protein  41.38 
 
 
64 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.160358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0231  hypothetical protein  37.93 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0021  hypothetical protein  41.38 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0407  hypothetical protein  41.67 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4302  hypothetical protein  36.23 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  0.0304485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1159  hypothetical protein  32.81 
 
 
64 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.136303 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0794  hypothetical protein  40.35 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0459  hypothetical protein  30.16 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000162501  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1506  hypothetical protein  41.67 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988537  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3267  hypothetical protein  36.51 
 
 
63 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1261  hypothetical protein  34.92 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.56018 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0347  hypothetical protein  31.58 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1064  hypothetical protein  40.68 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.710613  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1244  hypothetical protein  37.93 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822358  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0914  hypothetical protein  39.34 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0164503  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3714  hypothetical protein  36.21 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0621408 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>