14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28839 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_28839  AAAP family transporter: amino acid  100 
 
 
744 aa  1512    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.046591  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04428  amino acid transporter (Eurofung)  20.24 
 
 
555 aa  70.1  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227586  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57811  predicted protein  21.89 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00397212  normal  0.0130969 
 
 
-
 
NC_006686  CND06100  conserved hypothetical protein  22.87 
 
 
819 aa  53.9  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0680473  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04750  conserved hypothetical protein  22.16 
 
 
511 aa  53.5  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0726968  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40731  predicted protein  24.44 
 
 
584 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.247124  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07777  amino acid transporter (Eurofung)  23.06 
 
 
580 aa  52  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.14577  normal  0.468629 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_87014  predicted protein  21.03 
 
 
621 aa  50.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.728691  normal  0.601954 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf497  massive surface protein MspF  20.99 
 
 
2993 aa  49.3  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.378464  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30899  AAAP family transporter: amino acid  22.67 
 
 
529 aa  48.5  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49278  predicted protein  25.1 
 
 
618 aa  48.5  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04477  amino acid transporter (Eurofung)  21.95 
 
 
739 aa  48.1  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70212  Vacuolar amino acid transporter 7  23.01 
 
 
449 aa  47.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf653  massive surface protein MspH  20.66 
 
 
2438 aa  45.4  0.004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>