More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0668 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0668  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
374 aa  754    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.94771  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0260  rod shape-determining protein MreB  64.9 
 
 
330 aa  434  1e-120  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0471  rod shape-determining protein MreB  61.47 
 
 
330 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000843079  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1235  rod shape-determining protein MreB  56.14 
 
 
329 aa  367  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3282  rod shape-determining protein Mbl  52.92 
 
 
333 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000125947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3394  rod shape-determining protein Mbl  52.68 
 
 
333 aa  351  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3798  rod shape-determining protein Mbl  54.22 
 
 
333 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000087539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5404  rod shape-determining protein Mbl  53.57 
 
 
333 aa  343  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000385561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5455  rod shape-determining protein Mbl  53.57 
 
 
333 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5128  rod shape-determining protein Mbl  53.92 
 
 
333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000379199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4962  rod shape-determining protein Mbl  53.92 
 
 
333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.96321e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4974  rod shape-determining protein Mbl  53.92 
 
 
333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000021016  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5520  rod shape-determining protein Mbl  53.92 
 
 
333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5369  rod shape-determining protein Mbl  53.92 
 
 
333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5400  rod shape-determining protein Mbl  53.27 
 
 
333 aa  342  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000418455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5550  rod shape-determining protein Mbl  53.27 
 
 
333 aa  342  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000581144  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5077  rod shape-determining protein Mbl  53.61 
 
 
333 aa  341  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000326742  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  45.72 
 
 
339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  47.76 
 
 
342 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  47.76 
 
 
342 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  47.29 
 
 
340 aa  302  6.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  46.08 
 
 
340 aa  301  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  45.21 
 
 
346 aa  299  6e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  45.43 
 
 
339 aa  293  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  45.18 
 
 
349 aa  292  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2835  rod shape-determining protein Mbl  45.45 
 
 
345 aa  291  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  44.28 
 
 
343 aa  290  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  43.98 
 
 
343 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  43.99 
 
 
350 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  45.62 
 
 
343 aa  290  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  47.13 
 
 
345 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  45.35 
 
 
368 aa  288  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  44.88 
 
 
343 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  43.37 
 
 
342 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1874  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  43.15 
 
 
336 aa  285  7e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  45.35 
 
 
340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  44.78 
 
 
344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  45.02 
 
 
343 aa  283  5.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  44.61 
 
 
338 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  43.31 
 
 
339 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1993  rod shape-determining protein MreB  42.99 
 
 
340 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  43.98 
 
 
342 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  44.31 
 
 
339 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  44.31 
 
 
339 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  44.31 
 
 
339 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  44.31 
 
 
339 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  42.34 
 
 
343 aa  281  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  44.31 
 
 
339 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  42.44 
 
 
343 aa  280  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  44.31 
 
 
339 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  44.31 
 
 
339 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  44.31 
 
 
339 aa  280  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  44.31 
 
 
339 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  44.31 
 
 
339 aa  280  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  44.28 
 
 
343 aa  280  3e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1215  rod shape-determining protein MreB  46.25 
 
 
333 aa  279  5e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.020325  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  44.78 
 
 
344 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  44.78 
 
 
344 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  44.78 
 
 
344 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0512  rod shape-determining protein MreB  44.88 
 
 
333 aa  278  1e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  44.78 
 
 
344 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  44.48 
 
 
344 aa  278  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  41.62 
 
 
344 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  43.37 
 
 
343 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0375  rod shape-determining protein MreB  44.74 
 
 
336 aa  277  2e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  42.39 
 
 
347 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  42.39 
 
 
347 aa  276  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  42.47 
 
 
343 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  44.18 
 
 
344 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  42.09 
 
 
346 aa  276  5e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  45.18 
 
 
345 aa  276  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  44.18 
 
 
344 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  44.84 
 
 
347 aa  276  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  44.84 
 
 
347 aa  276  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  42.69 
 
 
347 aa  275  8e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  44.84 
 
 
347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  44.84 
 
 
347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  44.02 
 
 
346 aa  274  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  44.84 
 
 
347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  44.84 
 
 
347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  44.84 
 
 
347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  44.18 
 
 
344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  44.84 
 
 
347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  44.84 
 
 
347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  44.84 
 
 
347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  44.84 
 
 
347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  44.84 
 
 
347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  44.84 
 
 
347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  44.84 
 
 
347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  44.84 
 
 
347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  44.84 
 
 
347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  44.84 
 
 
347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  43.24 
 
 
343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  42.99 
 
 
347 aa  273  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  44.71 
 
 
344 aa  273  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  41.76 
 
 
338 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  42.39 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  44.25 
 
 
347 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  45.27 
 
 
345 aa  273  5.000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  42.77 
 
 
345 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>