33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0593 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0593  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  247  5e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667987  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1942  hypothetical protein  52.34 
 
 
128 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0685  hypothetical protein  59.06 
 
 
126 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504453  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1123  BA14K-like  70 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0272  hypothetical protein  40.56 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2716  BA14K family protein  61.82 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263756  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2493  BA14K family protein  61.82 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.279471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2421  BA14K family protein  61.82 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3174  hypothetical protein  39.26 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798003  normal  0.0785982 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3033  hypothetical protein  43.94 
 
 
201 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120218  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2889  hypothetical protein  43.48 
 
 
196 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00745568  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4232  hypothetical protein  73.33 
 
 
235 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5051  hypothetical protein  66.67 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567981  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2082  hypothetical protein  70.97 
 
 
172 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1022  BA14K-like  64.1 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5379  BA14K family protein  47.86 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2417  hypothetical protein  44.29 
 
 
223 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.0235404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2698  putative exported protein of unknown function  41.89 
 
 
209 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0170396  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1569  hypothetical protein  64.52 
 
 
211 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0534  hypothetical protein  77.78 
 
 
153 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3811  hypothetical protein  62.5 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0228634  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2464  hypothetical protein  80 
 
 
230 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6139  hypothetical protein  42.62 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3004  BA14K family protein  60 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2744  hypothetical protein  60 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2214  BA14K family protein  31.41 
 
 
161 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611064  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3014  hypothetical protein  59.26 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12196  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2137  hypothetical protein  32.98 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150789  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2373  hypothetical protein  60.71 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00903594  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2136  hypothetical protein  68 
 
 
210 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129106  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2722  hypothetical protein  56.25 
 
 
129 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.585488  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2438  hypothetical protein  55.56 
 
 
124 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3358  BA14K family protein  47.37 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>