16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0475 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0475  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  153  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0604  hypothetical protein  82.67 
 
 
76 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993744  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0050  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0092  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  48.48 
 
 
72 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0119  hypothetical protein  42.11 
 
 
85 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1716  hypothetical protein  39.19 
 
 
77 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.0942361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0684  hypothetical protein  51.02 
 
 
72 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3577  hypothetical protein  36.84 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.604321  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0279  hypothetical protein  61.9 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.778649  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2273  hypothetical protein  43.4 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179364  normal  0.226669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4265  hypothetical protein  38.33 
 
 
79 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1722  hypothetical protein  36.92 
 
 
79 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2686  hypothetical protein  37.29 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4740  hypothetical protein  37.84 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2965  hypothetical protein  43.4 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1689  hypothetical protein  39.39 
 
 
374 aa  40.4  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>