17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0355 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0355  TM2 domain containing protein?  100 
 
 
110 aa  220  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269193 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1652  TM2 domain-containing protein  75.36 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.503869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3451  hypothetical protein  65.79 
 
 
106 aa  108  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.950641  normal  0.149126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2044  hypothetical protein  46.67 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.00000000000114034  normal  0.017313 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22460  hypothetical protein  39.47 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0473  hypothetical protein  50 
 
 
71 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2493  TM2 domain-containing protein  42.5 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1190  hypothetical protein  37.97 
 
 
192 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.550664  normal  0.0144222 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1070  TM2 domain-containing protein  38.03 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3059  hypothetical protein  35.38 
 
 
68 aa  52.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.363371  normal  0.394347 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3060  hypothetical protein  42.19 
 
 
70 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.402263  normal  0.261186 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2096  hypothetical protein  37.97 
 
 
135 aa  50.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22710  hypothetical protein  30.77 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0702  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.09 
 
 
447 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1700  TM2 domain-containing protein  29.87 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0217305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0456  hypothetical protein  26.17 
 
 
262 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
426 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00161324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>