53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2692 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2692  OsmC family protein  100 
 
 
161 aa  320  4e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0751564  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  53.15 
 
 
152 aa  150  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136594  normal  0.328629 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20740  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  50 
 
 
131 aa  137  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104919  normal  0.0981692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8006  OsmC family protein  36.36 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2694  OsmC family protein  38.66 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448513  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0710  OsmC family protein  32.68 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1495  OsmC family protein  30.71 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2351  OsmC family protein  35.61 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1405  OsmC family protein  34.09 
 
 
148 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.969301  normal  0.041582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2855  OsmC family protein  31.41 
 
 
158 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7915  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  33.33 
 
 
138 aa  57.4  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30670  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  34.03 
 
 
171 aa  54.7  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5001  OsmC family protein  36.7 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000117697  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2578  OsmC family protein  27.56 
 
 
142 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2637  OsmC family protein  34.96 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2173  OsmC family protein  30.43 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1564  OsmC family protein  33.33 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1163  OsmC family protein  31.53 
 
 
143 aa  50.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000507704 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1983  OsmC family protein  29.23 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3731  OsmC family protein  30.61 
 
 
139 aa  50.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.159888 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1593  OsmC family protein  25.98 
 
 
141 aa  50.8  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2638  hypothetical protein  27.34 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2074  OsmC family protein  35.25 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12637  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1887  OsmC family protein  35 
 
 
140 aa  48.5  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000280458  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1570  OsmC family protein  30.94 
 
 
145 aa  48.5  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00295172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02740  OsmC family protein  27.64 
 
 
130 aa  48.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1931  OsmC family protein  31.34 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110591  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0648  OsmC-like protein  29.37 
 
 
142 aa  47.4  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000386556  normal  0.0907025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1951  OsmC-like protein  30.6 
 
 
141 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1997  OsmC family protein  30.6 
 
 
141 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.608934  normal  0.376979 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0784  OsmC family protein  31.13 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12938  hypothetical protein  28.26 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0241589  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2839  OsmC family protein  27.48 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23594  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4190  OsmC family protein  30.6 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.708913  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2780  OsmC family protein  29.41 
 
 
138 aa  45.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971962  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1591  OsmC family protein  36.26 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277142  normal  0.616103 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0861  OsmC family protein  29.63 
 
 
142 aa  44.7  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458786  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0203  OsmC family protein  27.03 
 
 
143 aa  44.3  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0158527  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2834  OsmC family protein  29.29 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1486  OsmC-like protein  25.71 
 
 
147 aa  43.9  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320434  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0008  OsmC family protein  25.69 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0008  OsmC family protein  26.36 
 
 
138 aa  43.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0674  OsmC family protein  28.71 
 
 
137 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.951893  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0153  OsmC family protein  28.3 
 
 
153 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.818803  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3662  hypothetical protein  32.74 
 
 
134 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.518022  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4579  hypothetical protein  30.89 
 
 
135 aa  42  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0329282  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2555  OsmC family protein  24.79 
 
 
140 aa  42  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706281  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0867  OsmC-like protein  25.24 
 
 
154 aa  42  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3736  hypothetical protein  32.74 
 
 
139 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3770  hypothetical protein  31.71 
 
 
134 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356475  normal  0.48627 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3662  hypothetical protein  32.74 
 
 
139 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.511979  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3833  hypothetical protein  31.71 
 
 
134 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54216  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1018  OsmC family protein  33.86 
 
 
142 aa  40.8  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>