17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1202 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1202  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7945  hypothetical protein  43.59 
 
 
185 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1095  DivIVA domain protein  46.48 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2146  hypothetical protein  36.67 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00360758  hitchhiker  0.00871202 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1838  hypothetical protein  47.22 
 
 
179 aa  53.9  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.450169  normal  0.227053 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0497  hypothetical protein  37.35 
 
 
174 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19450  hypothetical protein  56.41 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.735309  normal  0.0185539 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3838  hypothetical protein  61.9 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0245433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0779  hypothetical protein  60 
 
 
191 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1145  hypothetical protein  63.16 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.223752  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2519  hypothetical protein  51.28 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4507  hypothetical protein  41.18 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1171  DivIVA domain protein  36.63 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0878  hypothetical protein  47.37 
 
 
206 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06340  hypothetical protein  31.33 
 
 
104 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3309  DivIVA domain protein  38.71 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0698  hypothetical protein  34.18 
 
 
141 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>