17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0561 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0561  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 59 aa  121  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  52.63 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  55.32 
 
 		 77 aa  62  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  52 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  52 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0859  putative transcriptional regulator, MerR family  52.83 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4449  hypothetical protein  50.98 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2071  regulatory protein MerR  56.25 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000949054  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4829  hypothetical protein  41.07 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0479763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4915  hypothetical protein  41.07 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  42.86 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  42.86 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1723  hypothetical protein  45.1 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0794  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  42.31 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3570  excisionase/Xis, DNA-binding  41.67 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201756 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  40.82 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>