16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1899 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1899  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  168  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494272  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0651  hypothetical protein  27.16 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.248101  normal  0.0865626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1783  hypothetical protein  31.25 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0218342  normal  0.0624133 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1042  hypothetical protein  31.03 
 
 		 203 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0640  hypothetical protein  26.67 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.377237  normal  0.24293 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1643  hypothetical protein  25.88 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3763  hypothetical protein  37.68 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1313  hypothetical protein  30 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3074  hypothetical protein  34.57 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2974  peptidase  28.74 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.577103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3781  hypothetical protein  35.19 
 
 		 211 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1861  peptidase  36.36 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.746884  normal  0.0400575 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2219  hypothetical protein  40 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.927329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0619  hypothetical protein  29.63 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.669584 
 
 
-
 
NC_004310  BR1626  hypothetical protein  36.11 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.734997  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1568  hypothetical protein  36.11 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.370467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>