13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2219 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2219  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  177  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.927329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1863  hypothetical protein  38.75 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2198  hypothetical protein  38.75 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1814  hypothetical protein  44.29 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.882506  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1626  hypothetical protein  40.91 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.734997  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1568  hypothetical protein  40.91 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.370467  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3141  hypothetical protein  39.19 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1899  hypothetical protein  36.26 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3763  hypothetical protein  36.9 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3288  hypothetical protein  40 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.085788 
 
 
-
 
NC_004310  BR1634  hypothetical protein  31.76 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1042  hypothetical protein  28.57 
 
 		 203 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1577  hypothetical protein  31.76 
 
 		 105 aa  40  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>