31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2960 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2960  protein of unknown function DUF1508  100 
 
 
298 aa  569  1e-161  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0562  protein of unknown function DUF1508  38.11 
 
 
211 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0423  protein of unknown function DUF1508  30.37 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.558642  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2330  protein of unknown function DUF1508  53.33 
 
 
64 aa  69.7  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3547  protein of unknown function DUF1508  54.1 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2713  protein of unknown function DUF1508  51.47 
 
 
523 aa  68.9  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953901  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2059  protein of unknown function DUF1508  70.45 
 
 
509 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2647  protein of unknown function DUF1508  47.5 
 
 
557 aa  67  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2527  protein of unknown function DUF1508  52.83 
 
 
224 aa  65.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.595982  normal  0.191056 
 
 
-
 
NC_002936  DET1307  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.280375  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1089  hypothetical protein  48.21 
 
 
61 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1117  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2795  protein of unknown function DUF1508  51.11 
 
 
61 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0497827  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2504  protein of unknown function DUF1508  51.11 
 
 
61 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2572  hypothetical protein  51.11 
 
 
61 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259353  normal  0.786456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3815  hypothetical protein  53.33 
 
 
61 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.272281  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2678  hypothetical protein  44.64 
 
 
969 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5390  protein of unknown function DUF1508  52.27 
 
 
226 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7854  protein of unknown function DUF1508  40.74 
 
 
101 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1074  protein of unknown function DUF1508  42.86 
 
 
1001 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  44 
 
 
127 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0972  hypothetical protein  43.64 
 
 
56 aa  47  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.859574  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7233  protein of unknown function DUF1508  46.67 
 
 
61 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458818  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1784  hypothetical protein  38.18 
 
 
129 aa  46.6  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0566644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6482  hypothetical protein  44.44 
 
 
61 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.068016  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2449  protein of unknown function DUF1508  40.35 
 
 
61 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0826  hypothetical protein  40 
 
 
58 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1640  protein of unknown function DUF1508  40 
 
 
956 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2613  hypothetical protein  43.75 
 
 
110 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40017  normal  0.147293 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  37.5 
 
 
111 aa  42.7  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3548  protein of unknown function DUF1508  38.18 
 
 
62 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>