45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2290 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2290  protein of unknown function DUF1611  100 
 
 
341 aa  674    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0593  protein of unknown function DUF1611  73.02 
 
 
340 aa  506  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1623  protein of unknown function DUF1611  65.59 
 
 
363 aa  427  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.631955 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1378  protein of unknown function DUF1611  61.19 
 
 
337 aa  408  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0205  protein of unknown function DUF1611  42.57 
 
 
337 aa  258  8e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3511  hypothetical protein  38.89 
 
 
348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2779  hypothetical protein  42.86 
 
 
348 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3589  protein of unknown function DUF1611  36.28 
 
 
348 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0838311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1405  hypothetical protein  36.25 
 
 
348 aa  207  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4403  protein of unknown function DUF1611  35.78 
 
 
343 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.654147  hitchhiker  0.000982381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4341  protein of unknown function DUF1611  35.78 
 
 
343 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2372  hypothetical protein  36.1 
 
 
349 aa  200  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0852  hypothetical protein  34.84 
 
 
360 aa  176  5e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.98076  normal  0.809264 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1462  hypothetical protein  39.38 
 
 
346 aa  176  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204992  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0149  protein of unknown function DUF1611  37.91 
 
 
335 aa  172  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1206  protein of unknown function DUF1611  34.93 
 
 
331 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356367  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06557  hypothetical protein  37 
 
 
340 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3968  protein of unknown function DUF1611  36.79 
 
 
335 aa  170  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2482  hypothetical protein  35.53 
 
 
333 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1220  protein of unknown function DUF1611  35.52 
 
 
330 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3257  hypothetical protein  33.8 
 
 
359 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.161607  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1770  hypothetical protein  35.74 
 
 
333 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0416  hypothetical protein  35.53 
 
 
333 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0034  hypothetical protein  36.03 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0366  hypothetical protein  34.93 
 
 
333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2786  protein of unknown function DUF1611  35.22 
 
 
329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1127  hypothetical protein  38.1 
 
 
340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160448 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1819  hypothetical protein  43.8 
 
 
348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4657  hypothetical protein  38.1 
 
 
337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3166  hypothetical protein  34.78 
 
 
333 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4542  hypothetical protein  37.92 
 
 
340 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000678  EBNA-1 nuclear protein  36.63 
 
 
334 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0130  hypothetical protein  33.45 
 
 
338 aa  159  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.550989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0132  hypothetical protein  35.63 
 
 
338 aa  159  6e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2798  protein of unknown function DUF1611  37.79 
 
 
336 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0792  hypothetical protein  32.11 
 
 
365 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4476  protein of unknown function DUF1611  37.04 
 
 
340 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2789  hypothetical protein  32.98 
 
 
333 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2903  protein of unknown function DUF1611  37.45 
 
 
336 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2676  hypothetical protein  37.45 
 
 
336 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  0.475395 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2299  hypothetical protein  31.95 
 
 
392 aa  142  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2557  hypothetical protein  35.85 
 
 
335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1538  hypothetical protein  33.23 
 
 
353 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1935  protein of unknown function DUF1611  31.71 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614904  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1833  hypothetical protein  31.45 
 
 
371 aa  106  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>