22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0888 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0888  cobalt transport protein  100 
 
 
234 aa  447  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2737  cobalt transport protein  75.45 
 
 
234 aa  323  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0500  cobalt transport protein  58.04 
 
 
237 aa  236  3e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.455988 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0506  cobalt transport protein  48.93 
 
 
246 aa  202  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  27.8 
 
 
810 aa  58.5  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.65 
 
 
770 aa  56.2  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  24.43 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  26.98 
 
 
272 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  28.31 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  25.51 
 
 
269 aa  48.9  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  24.42 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  24.42 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  24.11 
 
 
264 aa  46.6  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.89 
 
 
264 aa  47  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  22.48 
 
 
264 aa  46.6  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1964  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit  24.7 
 
 
255 aa  45.4  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  24.3 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  25.74 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  25.74 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  28.19 
 
 
310 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  22.83 
 
 
267 aa  42.4  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.07 
 
 
266 aa  42.4  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>