13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0138 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0138    100 
 
 
235 bp  466  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128048  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4863  Integrase catalytic region  85.42 
 
 
678 bp  111  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4047  Integrase catalytic region  94.29 
 
 
678 bp  107  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4512    94.29 
 
 
518 bp  107  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4966  Integrase catalytic region  92.86 
 
 
678 bp  99.6  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4898    93.85 
 
 
678 bp  97.6  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.198767  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4889    91.67 
 
 
728 bp  95.6  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.163217  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3914  Integrase catalytic region  91.43 
 
 
678 bp  91.7  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.835776  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4099    90.77 
 
 
663 bp  81.8  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3181    85.71 
 
 
681 bp  65.9  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3184    85.71 
 
 
681 bp  65.9  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.981757  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4676    81.25 
 
 
674 bp  63.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2685    100 
 
 
642 bp  48.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00531158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>