15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4121 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4121  hypothetical protein  100 
 
 		 56 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.888422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1222  hypothetical protein  46.15 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1301  hypothetical protein  47.92 
 
 		 58 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0444  hypothetical protein  51.22 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.806822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4157  hypothetical protein  45.83 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.266074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4256  hypothetical protein  46.67 
 
 		 58 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  44 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.709838 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4647  hypothetical protein  46 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  0.0683447 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8726  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1605  hypothetical protein  54.55 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.857715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0037  hypothetical protein  51.43 
 
 		 119 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3082  hypothetical protein  54.55 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3809  hypothetical protein  54.55 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0880323  normal  0.230333 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5025  hypothetical protein  42.86 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  59.38 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>