12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3236 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3236  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  461  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4379  hypothetical protein  73.95 
 
 		 219 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.0130562 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4211  hypothetical protein  68.64 
 
 		 237 aa  321  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4988  hypothetical protein  67.87 
 
 		 221 aa  317  7e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4316  hypothetical protein  67.56 
 
 		 226 aa  314  9e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2311  hypothetical protein  61.26 
 
 		 222 aa  295  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3235  hypothetical protein  25.42 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2312  hypothetical protein  27.03 
 
 		 253 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0886961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4315  hypothetical protein  26.27 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4210  hypothetical protein  26.27 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4378  hypothetical protein  25.42 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  0.0281259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4987  hypothetical protein  26.27 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>