13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1357 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1357  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  363  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.783887  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1358  hypothetical protein  61.11 
 
 		 181 aa  227  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1982  hypothetical protein  59.77 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.98648  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0017  hypothetical protein  47.43 
 
 		 183 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3653  hypothetical protein  45.76 
 
 		 179 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1863  hypothetical protein  32.73 
 
 		 182 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.730631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4170  hypothetical protein  39.78 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000403496  normal  0.117669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0186  hypothetical protein  42 
 
 		 205 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0813  hypothetical protein  34.65 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1620  hypothetical protein  38.14 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.71975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0021  hypothetical protein  36.7 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1117  hypothetical protein  45.07 
 
 		 80 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3053  hypothetical protein  32 
 
 		 119 aa  52.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>