25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0806 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3263  IS5 family transposase OrfA  100 
 
 
369 bp  541  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2136  IS5 family transposase OrfA  100 
 
 
369 bp  541  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0806    100 
 
 
273 bp  541  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1595  IS5 family transposase OrfA  100 
 
 
369 bp  539  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3954    86.45 
 
 
754 bp  240  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4216  IS5 family transposase OrfA  85.07 
 
 
369 bp  214  9e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1600  hypothetical protein  87.5 
 
 
294 bp  127  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2771  transposase  86.32 
 
 
387 bp  85.7  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.447174  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0420  transposase  84.85 
 
 
369 bp  77.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2607  transposase  84.85 
 
 
369 bp  77.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2459  transposase  84.85 
 
 
369 bp  77.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2348  transposase  84.85 
 
 
369 bp  77.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00257505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2028  transposase  84.85 
 
 
369 bp  77.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1688  transposase  84.85 
 
 
369 bp  77.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1646  transposase  84.85 
 
 
369 bp  77.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1642  transposase  84.85 
 
 
369 bp  77.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1526  transposase  84.85 
 
 
369 bp  77.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1320  transposase  84.85 
 
 
369 bp  77.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1299  transposase  84.85 
 
 
369 bp  77.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.594547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0837  transposase  84.85 
 
 
369 bp  77.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.456928  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0598  transposase  84.85 
 
 
369 bp  77.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3927    92 
 
 
424 bp  67.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.821582  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0530  IS5 family transposase orfA  84.09 
 
 
369 bp  63.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0255453  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0534  IS5 family transposase orfA  84.09 
 
 
369 bp  63.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3761    80.81 
 
 
759 bp  46.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>