15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0604 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0604  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  152  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993744  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0475  hypothetical protein  81.58 
 
 		 76 aa  129  9e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0050  hypothetical protein  52.63 
 
 		 74 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1716  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.0942361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0119  hypothetical protein  45.07 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0279  hypothetical protein  73.81 
 
 		 67 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.778649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3577  hypothetical protein  44.87 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.604321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2273  hypothetical protein  50.94 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179364  normal  0.226669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0092  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  48.48 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0684  hypothetical protein  53.06 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4265  hypothetical protein  42.42 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1722  hypothetical protein  44.62 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2686  hypothetical protein  42.37 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2965  hypothetical protein  44.83 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4740  hypothetical protein  36.49 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>