18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0375 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  98.39 
 
 		 1113 bp  920    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  98.19 
 
 		 1104 bp  912    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  98.39 
 
 		 1104 bp  920    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0375    100 
 
 		 560 bp  1110    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  98.59 
 
 		 1113 bp  928    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  98.39 
 
 		 1113 bp  920    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  83.25 
 
 		 1089 bp  125  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  83.25 
 
 		 1089 bp  125  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  83.25 
 
 		 1023 bp  125  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  83.25 
 
 		 1089 bp  125  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  83.25 
 
 		 1089 bp  125  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8061    82.76 
 
 		 1096 bp  71.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8192    82.76 
 
 		 792 bp  71.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8196    82.76 
 
 		 1100 bp  71.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  82.76 
 
 		 1101 bp  71.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9090    82.76 
 
 		 1093 bp  71.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  81.9 
 
 		 1098 bp  63.9  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  85.71 
 
 		 1095 bp  48.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>