29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1849 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1849  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 361 aa  701    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.353414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0538  sodium/calcium exchanger membrane region  62.06 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0449  sodium/calcium exchanger membrane region  61.47 
 
 		 347 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.589797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12780  Ca2+/Na+ antiporter  59.48 
 
 		 345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.63097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3907  sodium/calcium exchanger membrane region  42.82 
 
 		 341 aa  259  7e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.93815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1499  sodium/calcium exchanger membrane region  46.32 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1450  sodium/calcium exchanger membrane region  47.19 
 
 		 355 aa  243  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.879027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1223  Sodium/calcium exchanger membrane region  40.73 
 
 		 339 aa  233  5e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4761  sodium/calcium exchanger membrane region  28.07 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1175  sodium/calcium exchanger membrane region  24.57 
 
 		 348 aa  97.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.606796  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6944  sodium/calcium exchanger membrane region  27.48 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0274  sodium/calcium exchanger membrane region  24.02 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2147  sodium/calcium exchanger membrane region  28.48 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1122  sodium/calcium exchanger membrane region  26.63 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3609  sodium/calcium exchanger membrane region  25.6 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4299  sodium/calcium exchanger membrane region  25.59 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0384  sodium/calcium exchanger membrane region  25.95 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3831  cation antiporter (Na+/Ca2+)  26.76 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0850  cation transporter, putative  25.8 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.495798  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2983  sodium/calcium exchanger membrane region  26.98 
 
 		 334 aa  67  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39585  normal  0.0260778 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1133  sodium/calcium exchanger membrane protein  26.75 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000089866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3080  sodium/calcium exchanger membrane protein  26.54 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.036167  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0501  Ca2+/H+ antiporter  27.94 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0004  putative CaCA family sodium/calcium exchanger  26.34 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06231  CaCA family sodium/calcium exchanger  26.34 
 
 		 364 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.379015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2416  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  43.04 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  22.4 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0504  sodium/calcium exchanger protein  23.84 
 
 		 322 aa  43.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>