19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1135 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1135  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  340  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.22269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2204  hypothetical protein  48.8 
 
 		 171 aa  121  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000962337  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12850  hypothetical protein  43.18 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.822848 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3628  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3838  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000189595  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8892  hypothetical protein  35.56 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 120 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  33.04 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 126 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 125 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  34.69 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  37.35 
 
 		 122 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0317  regulatory protein ArsR  25.37 
 
 		 143 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 		 129 aa  42  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 115 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 87 aa  41.2  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 331 aa  40.8  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>