33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0166 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0166  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  158  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21130  hypothetical protein  61.73 
 
 		 81 aa  96.3  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0766  hypothetical protein  59.26 
 
 		 81 aa  92.4  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25220  hypothetical protein  56.79 
 
 		 82 aa  90.1  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2786  hypothetical protein  68.49 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.174282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4685  hypothetical protein  56.92 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.0563131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4034  hypothetical protein  57.63 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2949  normal  0.231801 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0726  hypothetical protein  52.94 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6793  hypothetical protein  56.06 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8454  hypothetical protein  56.92 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3019  hypothetical protein  58.73 
 
 		 73 aa  63.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  hitchhiker  0.0088907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7220  hypothetical protein  60 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3156  hypothetical protein  57.14 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3038  hypothetical protein  53.85 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7210  hypothetical protein  52.94 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.659998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1623  hypothetical protein  52.31 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0694  hypothetical protein  47.83 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0548388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0714  hypothetical protein  47.83 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416278 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0700  hypothetical protein  47.83 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1761  hypothetical protein  49.21 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000459552  normal  0.237306 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3539  hypothetical protein  45.07 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1599  hypothetical protein  51.72 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.124638  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1048  hypothetical protein  47.62 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3763  hypothetical protein  48.28 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3453  hypothetical protein  44.12 
 
 		 73 aa  47.4  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0500365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3380  hypothetical protein  48.94 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0872841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5440  hypothetical protein  35.38 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1784  hypothetical protein  56.41 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00678784  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0610  Clp domain protein  45.65 
 
 		 242 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4091  Clp domain-containing protein  48.78 
 
 		 257 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0455898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5168  Clp domain protein  40.82 
 
 		 237 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12682  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC2  43.75 
 
 		 252 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0325769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3907  Clp N terminal domain-containing protein  44.44 
 
 		 240 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>