18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4956 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4956  biotin carboxylase-like protein  100 
 
 		 541 aa  1113    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11736  biotin carboxylase-like protein  45.21 
 
 		 494 aa  449  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000368956  normal  0.822506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3329  pyruvate carboxylase  24.68 
 
 		 1158 aa  51.2  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0677  pyruvate carboxylase  23.77 
 
 		 1154 aa  51.2  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418471 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0765  pyruvate carboxylase  22.96 
 
 		 1154 aa  50.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2090  pyruvate carboxylase  22.96 
 
 		 1154 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4597  pyruvate carboxylase  23.73 
 
 		 1157 aa  48.5  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4375  pyruvate carboxylase  22.95 
 
 		 1153 aa  48.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1119  pyruvate carboxylase  24.6 
 
 		 1169 aa  48.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1716  pyruvate carboxylase  24.68 
 
 		 1158 aa  47.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0972  pyruvate carboxylase  22.82 
 
 		 1165 aa  47.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_004310  BR1781  pyruvate carboxylase  24.68 
 
 		 1158 aa  47.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2028  pyruvate carboxylase  22.61 
 
 		 1146 aa  47.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2760  putative biotin carboxylase subunit of acetyl-CoA carboxylase  20.99 
 
 		 681 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868183  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1360  pyruvate carboxylase  22.98 
 
 		 1147 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0615601 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1511  pyruvate carboxylase subunit A  23.68 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473143  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2718  pyruvate carboxylase subunit A  23.79 
 
 		 471 aa  44.3  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2485  pyruvate carboxylase  23.18 
 
 		 1145 aa  43.5  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>