23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4754 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4754  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0102  cell wall anchor domain-containing protein  30.11 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0098  cell wall anchor domain-containing protein  30.11 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  27.59 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0662  hypothetical protein  42.27 
 
 		 444 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00226884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0653  antigen 34 kDa family protein  31.94 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  28.22 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  33.73 
 
 		 985 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  84.21 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  84.21 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  84.21 
 
 		 398 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  27.42 
 
 		 2179 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0857  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1060 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1797  hypothetical protein  24.53 
 
 		 195 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.154956  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  30.32 
 
 		 1113 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  28.95 
 
 		 230 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44441  predicted protein  32.91 
 
 		 4500 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2572  hypothetical protein  24.75 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00288379  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24137  predicted protein  30.84 
 
 		 1189 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  26.61 
 
 		 2272 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  25.6 
 
 		 1888 aa  43.1  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0033  FHA domain containing protein  47.76 
 
 		 428 aa  42.7  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  28.72 
 
 		 236 aa  42.4  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>