16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3984 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3984  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  441  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00116122  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1315  hypothetical protein  35.77 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1444  hypothetical protein  33.45 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1129  hypothetical protein  33.61 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  0.291752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1402  hypothetical protein  31.13 
 
 
268 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3284  hypothetical protein  34.84 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2433  hypothetical protein  34.98 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0549482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3963  hypothetical protein  34.73 
 
 
232 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311022  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1441  hypothetical protein  36.59 
 
 
243 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1485  hypothetical protein  32.03 
 
 
267 aa  52.4  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2161  hypothetical protein  33.05 
 
 
228 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711551  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2207  hypothetical protein  33.05 
 
 
228 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0934997 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2148  hypothetical protein  33.05 
 
 
228 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0117779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2226  hypothetical protein  32.93 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12741  hypothetical protein  33.75 
 
 
231 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.39574 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1235  hypothetical protein  35.58 
 
 
236 aa  45.1  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518209  normal  0.0783886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>