More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3874 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_02621  N-(5-amino-5-carboxypentanoyl)-L-cysteinyl-D- valine synthase (EC 6.3.2.26)(Delta-(L-alpha-aminoadipyl)-L-cysteinyl-D- valine synthetase)(ACV synthetase)(ACVS) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P27742]  31.18 
 
 
3770 aa  698    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.830211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  34.41 
 
 
4383 aa  728    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  36.47 
 
 
3470 aa  837    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  37.93 
 
 
2370 aa  861    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  35.04 
 
 
2174 aa  765    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  36.52 
 
 
4317 aa  848    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  28.32 
 
 
2387 aa  657    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  37.47 
 
 
5953 aa  911    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  38.13 
 
 
6889 aa  929    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.59 
 
 
2385 aa  876    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.29 
 
 
4336 aa  867    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  34.41 
 
 
4968 aa  890    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  35.71 
 
 
2151 aa  851    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  35.31 
 
 
2386 aa  900    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  37.13 
 
 
4342 aa  891    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  35.63 
 
 
5929 aa  791    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  37.68 
 
 
8646 aa  867    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  35.8 
 
 
3432 aa  854    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  36.2 
 
 
4531 aa  843    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.71 
 
 
2385 aa  870    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2570  amino acid adenylation domain-containing protein  28.71 
 
 
3114 aa  661    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0117255 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  33.78 
 
 
2385 aa  873    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  33.84 
 
 
2385 aa  873    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  43.13 
 
 
2125 aa  1034    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  39.05 
 
 
3328 aa  874    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  35.16 
 
 
3331 aa  728    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  35.35 
 
 
3021 aa  783    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  31.04 
 
 
6404 aa  730    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  35.79 
 
 
4336 aa  853    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  36.01 
 
 
2154 aa  852    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  28.05 
 
 
3395 aa  718    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  34.92 
 
 
2201 aa  724    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  36.12 
 
 
5926 aa  802    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  35.05 
 
 
9498 aa  817    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  36.18 
 
 
5372 aa  805    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  33.39 
 
 
5469 aa  688    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  35.91 
 
 
13537 aa  870    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  36.52 
 
 
6676 aa  862    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  39.23 
 
 
3629 aa  795    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  30.77 
 
 
2867 aa  661    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  31.28 
 
 
2791 aa  713    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  36.95 
 
 
4991 aa  839    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  35.85 
 
 
3308 aa  942    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  36.6 
 
 
3498 aa  1008    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  34.91 
 
 
8915 aa  694    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  35.39 
 
 
3348 aa  801    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  35.84 
 
 
4468 aa  814    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  34.17 
 
 
6176 aa  667    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  35.76 
 
 
6274 aa  729    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  38.1 
 
 
6661 aa  910    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  39.06 
 
 
6072 aa  875    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  36.2 
 
 
4572 aa  820    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  35.24 
 
 
3291 aa  794    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  28.5 
 
 
4080 aa  682    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  36.35 
 
 
4502 aa  910    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  33.94 
 
 
2136 aa  679    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  34.92 
 
 
5422 aa  719    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  36.25 
 
 
4882 aa  825    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  35.19 
 
 
3002 aa  800    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2088  amino acid adenylation domain-containing protein  29.6 
 
 
2894 aa  725    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  36.65 
 
 
4332 aa  881    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  36.53 
 
 
3219 aa  641    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.71 
 
 
2385 aa  870    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  32.24 
 
 
4037 aa  676    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  29.48 
 
 
2138 aa  750    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  35.96 
 
 
5596 aa  824    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  36.27 
 
 
3296 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  38.92 
 
 
4290 aa  816    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  40.62 
 
 
4489 aa  922    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  37.72 
 
 
2605 aa  761    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  34.57 
 
 
3102 aa  736    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  35.98 
 
 
2350 aa  691    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  37.63 
 
 
7785 aa  813    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  36.46 
 
 
4317 aa  849    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  36.79 
 
 
3231 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  38.42 
 
 
1726 aa  796    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  33.61 
 
 
2187 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  32.83 
 
 
3291 aa  894    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  35.77 
 
 
3176 aa  814    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  36.37 
 
 
5230 aa  799    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  36.81 
 
 
5620 aa  806    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  37.29 
 
 
4342 aa  900    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  36.65 
 
 
5149 aa  808    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  37.68 
 
 
2189 aa  878    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  37.17 
 
 
2448 aa  868    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3098  amino acid adenylation domain-containing protein  35.86 
 
 
3524 aa  702    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  36.79 
 
 
3231 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  31.06 
 
 
2151 aa  699    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  37.05 
 
 
5328 aa  881    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  34.36 
 
 
5467 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  39.05 
 
 
6081 aa  872    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  38.28 
 
 
8914 aa  884    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  37.45 
 
 
6999 aa  758    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  39.05 
 
 
3352 aa  875    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  32.5 
 
 
2820 aa  644    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  33.76 
 
 
1714 aa  822    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  34.12 
 
 
2156 aa  931    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  35.7 
 
 
6271 aa  728    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  39.12 
 
 
6006 aa  875    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1780  amino acid adenylation domain-containing protein  29.82 
 
 
1922 aa  781    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>