36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3364 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3364  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  657    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000469169  normal  0.0159414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4442  hypothetical protein  50.74 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0722  hypothetical protein  46 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26660  predicted glycosyl transferase  45.13 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.666341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3875  hypothetical protein  41.58 
 
 		 325 aa  149  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1172  hypothetical protein  35.07 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.669426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0202  hypothetical protein  33.89 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0145  hypothetical protein  33.61 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.472245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0286  hypothetical protein  33.53 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5106  hypothetical protein  37.06 
 
 		 344 aa  126  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.126128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1231  hypothetical protein  33.9 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1393  hypothetical protein  35.19 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.650924  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19760  predicted glycosyl transferase  34 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0140  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  33.14 
 
 		 355 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.869609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0145  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  32.76 
 
 		 355 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0236903  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0144  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  32.76 
 
 		 355 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.482081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0140  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  32.76 
 
 		 355 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000138644 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0137  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  32.92 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.861141 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0636  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  32.45 
 
 		 354 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0279492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0098  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  31.43 
 
 		 355 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.371224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00090  hypothetical protein  31.43 
 
 		 355 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.628972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0095  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  31.43 
 
 		 355 aa  47  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0083  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  31.43 
 
 		 355 aa  47  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00091  N-acetylglucosaminyl transferase  31.43 
 
 		 355 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.669731  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3567  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  31.43 
 
 		 355 aa  47  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  hitchhiker  0.00628085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0092  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  31.43 
 
 		 355 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00165151  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0096  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  31.43 
 
 		 355 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.178087  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3510  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  31.43 
 
 		 355 aa  47  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3518  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  34.43 
 
 		 356 aa  46.2  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3387  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  34.43 
 
 		 356 aa  46.2  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2918  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  34.43 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  44.23 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6292  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N-acetylglucosaminyltransferase  37.04 
 
 		 389 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2799  hypothetical protein  37.82 
 
 		 410 aa  43.5  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0922  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  32.31 
 
 		 356 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3947  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  35.44 
 
 		 386 aa  42.7  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>