26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3007 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3007  ChaB family protein  100 
 
 		 141 aa  288  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000471912  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3411  hypothetical protein  72.66 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02480  ChaB protein  68.31 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0871  ChaB family protein  65.96 
 
 		 140 aa  177  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0793  ChaB family protein  64.29 
 
 		 139 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3665  ChaB family protein  62.14 
 
 		 139 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3652  ChaB  62.14 
 
 		 139 aa  167  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3725  ChaB family protein  62.14 
 
 		 139 aa  167  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14450  hypothetical protein  65.62 
 
 		 136 aa  156  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4490  ChaB family protein  63.36 
 
 		 134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4587  ChaB family protein  60.9 
 
 		 138 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1756  hypothetical protein  60.47 
 
 		 134 aa  147  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721453  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5498  hypothetical protein  63.79 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00390859  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2742  ChaB family protein  59.52 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.764397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0893  hypothetical protein  58.91 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1742  hypothetical protein  56.59 
 
 		 137 aa  133  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198279  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2019  ChaB family protein  54.14 
 
 		 142 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1804  hypothetical protein  60.5 
 
 		 133 aa  127  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1538  hypothetical protein  55.38 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.213562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0646  hypothetical protein  57.14 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22380  hypothetical protein  35.58 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23330  hypothetical protein  43.64 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1024  hypothetical protein  34.55 
 
 		 108 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2438  hypothetical protein  61.29 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.942157  normal  0.831641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3307  hypothetical protein  61.29 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0203584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64490  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>