55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5458 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5458  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  655    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1334  hypothetical protein  88.48 
 
 		 330 aa  591  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5230  hypothetical protein  77.58 
 
 		 330 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.753806 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4951  hypothetical protein  77.58 
 
 		 330 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4862  hypothetical protein  77.58 
 
 		 330 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13725  transmembrane protein  69.39 
 
 		 330 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258744  normal  0.61477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1404  membrane protein-like protein  66.87 
 
 		 331 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2502  putative integral membrane protein  57.19 
 
 		 331 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4050  protein of unknown function DUF95 transmembrane  55.02 
 
 		 331 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3752  protein of unknown function DUF95 transmembrane  55.72 
 
 		 334 aa  329  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0756  hypothetical protein  52 
 
 		 336 aa  326  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4823  protein of unknown function DUF95 transmembrane  49.38 
 
 		 331 aa  323  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3912  integral membrane protein  52.01 
 
 		 331 aa  321  9.000000000000001e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00542014  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5852  hypothetical protein  49.85 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7600  protein of unknown function DUF95 transmembrane  48.5 
 
 		 333 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0773481  normal  0.0891448 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2521  protein of unknown function DUF95 transmembrane  51.2 
 
 		 329 aa  300  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.626612  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3829  protein of unknown function DUF95 transmembrane  49.4 
 
 		 332 aa  298  6e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157843  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09270  uncharacterized membrane protein  47.99 
 
 		 329 aa  287  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.130747 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2338  protein of unknown function DUF95 transmembrane  49.69 
 
 		 329 aa  288  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00579329  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1202  integral membrane protein  44.72 
 
 		 328 aa  286  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.525523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1613  hypothetical protein  47.52 
 
 		 337 aa  282  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0233991 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1272  protein of unknown function DUF95 transmembrane  43.03 
 
 		 328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000243278 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1835  protein of unknown function DUF95 transmembrane  45.68 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.920974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20720  uncharacterized membrane protein  43.03 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3801  hypothetical protein  32.24 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1082  hypothetical protein  29.72 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3743  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.79 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3215  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.21 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0604768  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2278  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.75 
 
 		 320 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3128  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.43 
 
 		 342 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0462  hypothetical protein  31.29 
 
 		 356 aa  97.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4440  integral membrane protein  25.51 
 
 		 325 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.627062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3317  hypothetical protein  24.69 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4888  hypothetical protein  25.52 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.32174  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56110  hypothetical protein  25.61 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2967  hypothetical protein  27.96 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal  0.0170262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4811  hypothetical protein  23.17 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00997057  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0410  hypothetical protein  25.57 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4267  hypothetical protein  25.15 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000574123  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38340  hypothetical protein  24.5 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.5603  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3844  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.76 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2676  hypothetical protein  29.25 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3575  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.27 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09283  hypothetical protein  22.59 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4959  protein of unknown function DUF95 transmembrane  23.37 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000637265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2133  hypothetical protein  25.16 
 
 		 603 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0233  protein of unknown function DUF95 transmembrane  20.41 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4318  integral membrane protein  22.15 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4022  integral membrane protein  22.59 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96338  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2232  hypothetical protein  22.3 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2368  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.1 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1683  protein of unknown function DUF95 transmembrane  22.26 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3166  protein of unknown function DUF95 transmembrane  32.21 
 
 		 509 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1639  hypothetical protein  30.1 
 
 		 193 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0289  integral membrane protein  31.97 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271645  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>