18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5165 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5165  nuclear transport factor 2  100 
 
 
143 aa  294  4e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1592  nuclear transport factor 2  89.58 
 
 
144 aa  268  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4969  nuclear transport factor 2  83.33 
 
 
143 aa  243  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4586  nuclear transport factor 2  81.16 
 
 
143 aa  238  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4674  nuclear transport factor 2  81.16 
 
 
143 aa  238  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10775  hypothetical protein  70.71 
 
 
139 aa  216  7e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3853  hypothetical protein  37.6 
 
 
136 aa  89.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4417  nuclear transport factor 2  34.4 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2441  hypothetical protein  35.88 
 
 
133 aa  84.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.655393  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1249  hypothetical protein  35.51 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.64479  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3969  hypothetical protein  34.62 
 
 
149 aa  77  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15097  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12079  hypothetical protein  28.24 
 
 
265 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  30.83 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3596  nuclear transport factor 2  30.36 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2918  nuclear transport factor 2  25.76 
 
 
274 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2932  nuclear transport factor 2  25.76 
 
 
274 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2888  nuclear transport factor 2  25.76 
 
 
274 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0754079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2031  putative ketosteroid isomerase  19.81 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>