24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1542 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1542    100 
 
 		 484 bp  959    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  86.47 
 
 		 1551 bp  406  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  93.94 
 
 		 1608 bp  297  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  87.5 
 
 		 1560 bp  206  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  87.82 
 
 		 1554 bp  200  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  86.8 
 
 		 1575 bp  184  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  86.73 
 
 		 1782 bp  91.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  86.73 
 
 		 1782 bp  91.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  85.71 
 
 		 1746 bp  83.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  85.71 
 
 		 1737 bp  83.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  85.71 
 
 		 1746 bp  83.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1066    83.67 
 
 		 2897 bp  67.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  83.67 
 
 		 1737 bp  67.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  83.67 
 
 		 1737 bp  67.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  83.67 
 
 		 1737 bp  67.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  92 
 
 		 1560 bp  67.9  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  100 
 
 		 1761 bp  56  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  94.44 
 
 		 1641 bp  56  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  89.36 
 
 		 1653 bp  54  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  96.67 
 
 		 1749 bp  52  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  93.94 
 
 		 1812 bp  50.1  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  100 
 
 		 1575 bp  48.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  93.55 
 
 		 1806 bp  46.1  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3701  hypothetical protein  96.3 
 
 		 390 bp  46.1  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>