45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0129 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0129  cyclase/dehydrase  100 
 
 
146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692417  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  82.19 
 
 
146 aa  261  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  76.55 
 
 
148 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  76.55 
 
 
148 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  76.55 
 
 
148 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  66.44 
 
 
161 aa  205  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  26.95 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  24.06 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  22.3 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  22.22 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  24.26 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  22.14 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  22.14 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  22.14 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  24.64 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  27.4 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  25.71 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  23.65 
 
 
160 aa  53.5  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  26.03 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  26.28 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  24.11 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  24.44 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  25 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  25 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  24.29 
 
 
147 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  22.14 
 
 
146 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  23.7 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  23.7 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  25.87 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  23.7 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  25 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  25.55 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  21.01 
 
 
145 aa  47.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  23.7 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  23.7 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  23.7 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  26.09 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  26.09 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  23.91 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  25.36 
 
 
145 aa  43.9  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  24.64 
 
 
145 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  28.24 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  23.38 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  38.78 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  23.91 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>