31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3393 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3393    100 
 
 		 304 bp  603  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  86.47 
 
 		 267 bp  113  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  86.47 
 
 		 267 bp  113  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  85.28 
 
 		 267 bp  109  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  85.28 
 
 		 267 bp  109  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  85.82 
 
 		 267 bp  91.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  88.37 
 
 		 267 bp  91.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  88.37 
 
 		 267 bp  91.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  88.37 
 
 		 267 bp  91.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  88.37 
 
 		 267 bp  91.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2044  transposase IS3/IS911  82.25 
 
 		 321 bp  89.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2497    84.38 
 
 		 1092 bp  87.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0863968 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2592    85.04 
 
 		 257 bp  85.7  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.743625  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0515    92.98 
 
 		 225 bp  81.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.291374  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0519    92.98 
 
 		 268 bp  81.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3735  transposase IS3/IS911 family protein  87.06 
 
 		 324 bp  81.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  83.33 
 
 		 267 bp  79.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1568    83.33 
 
 		 266 bp  79.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2385  transposase IS3/IS911 family protein  87.5 
 
 		 213 bp  79.8  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  84 
 
 		 1182 bp  77.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1497    86.11 
 
 		 2972 bp  63.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4004    87.1 
 
 		 204 bp  60  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2967  transposase IS3/IS911  88.89 
 
 		 288 bp  60  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.142788 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  88.68 
 
 		 267 bp  58  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1901  hypothetical protein  86.67 
 
 		 132 bp  56  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0434899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  87.04 
 
 		 267 bp  52  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  87.04 
 
 		 267 bp  52  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  87.04 
 
 		 267 bp  52  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  84.38 
 
 		 924 bp  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00237  transposase  87.5 
 
 		 237 bp  48.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5713    87.23 
 
 		 1992 bp  46.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>