21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2393 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2393  protein of unknown function DUF447  100 
 
 
185 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5940  hypothetical protein  54.1 
 
 
197 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4099  hypothetical protein  55.93 
 
 
189 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6498  hypothetical protein  54.35 
 
 
201 aa  191  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760399  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3074  protein of unknown function DUF447  52.84 
 
 
193 aa  181  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2455  hypothetical protein  52.25 
 
 
199 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.11758  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2726  hypothetical protein  54.55 
 
 
196 aa  177  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1580  hypothetical protein  49.71 
 
 
191 aa  177  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000289305  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1841  hypothetical protein  50.57 
 
 
198 aa  171  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1792  hypothetical protein  50.57 
 
 
198 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2176  protein of unknown function DUF447  50 
 
 
198 aa  169  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3142  hypothetical protein  50.85 
 
 
195 aa  169  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2617  hypothetical protein  50.26 
 
 
196 aa  168  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0409017  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1244  hypothetical protein  51.55 
 
 
176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5018  hypothetical protein  50.57 
 
 
198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5322  protein of unknown function DUF447  50.28 
 
 
199 aa  159  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2424  protein of unknown function DUF447  34.2 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0904426  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1353  hypothetical protein  23.86 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0214  hypothetical protein  26.11 
 
 
198 aa  48.9  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1323  hypothetical protein  24 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0630  hypothetical protein  24 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>