16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0866 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0866  pentapeptide MXKDX repeat protein  100 
 
 
86 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0017  hypothetical protein  54.76 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0020  hypothetical protein  52.94 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  58.33 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  56.67 
 
 
109 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2593  hypothetical protein  45.24 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4104  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  49.28 
 
 
92 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4593  hypothetical protein  44.59 
 
 
116 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4814  pentapeptide MXKDX repeat protein  49.37 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.901496  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2570  pentapeptide MXKDX repeat protein  40.96 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296562  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1511  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  40.48 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.144611  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0540  hypothetical protein  45.68 
 
 
93 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4332  hypothetical protein  56.86 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.834965  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1233  transcription termination factor Rho  48.15 
 
 
653 aa  41.2  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4053  hypothetical protein  44.71 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1517  hypothetical protein  52.94 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>