15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2223 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2223  SSU ribosomal protein S27AE  100 
 
 		 61 aa  127  7.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000310911 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1409  Ribosomal protein S27a  68.85 
 
 		 63 aa  89.4  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0449  ribosomal protein S27a  69.05 
 
 		 53 aa  72.8  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0307  30S ribosomal protein S27ae  50.91 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1439  30S ribosomal protein S27ae  51.02 
 
 		 65 aa  60.1  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.143356  normal  0.0246372 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1198  30S ribosomal protein S27ae  51.02 
 
 		 63 aa  60.1  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.591289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1894  30S ribosomal protein S27ae  48.98 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0594  ribosomal protein S27a  45.45 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0564  Ribosomal protein S27a  56 
 
 		 50 aa  50.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0284  ribosomal protein S27a  43.64 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.473204  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1325  ribosomal protein S27a  46.67 
 
 		 49 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0654  SSU ribosomal protein S27AE  41.67 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.663989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0599  Ribosomal protein S27a  40 
 
 		 51 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0241  ribosomal protein S27a  38.78 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.834895 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0467  30S ribosomal protein S27ae  39.22 
 
 		 67 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>