19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1526 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1526  DHH superfamily phosphohydrolase  100 
 
 
323 aa  659    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.390938 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0259  phosphoesterase DHHA1  64.47 
 
 
329 aa  464  9.999999999999999e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2207  phosphoesterase DHHA1  28.15 
 
 
321 aa  90.9  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2823  phosphoesterase, DHHA1  25.35 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0433  hypothetical protein  25.53 
 
 
323 aa  87.4  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2015  phosphoesterase, DHHA1  23.45 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0808  phosphoesterase, DHHA1  25 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0016  hypothetical protein  25.15 
 
 
325 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.054001  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1518  phosphoesterase, DHHA1  32.28 
 
 
312 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1098  phosphoesterase DHHA1  24.52 
 
 
380 aa  58.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1309  hypothetical protein  23.02 
 
 
429 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1145  phosphoesterase DHHA1  22.55 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.228943  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0888  phosphoesterase, DHHA1  24.62 
 
 
322 aa  50.4  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.141577  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1398  phosphoesterase, DHHA1  26.76 
 
 
311 aa  50.1  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0225  RecJ-like exonuclease  23.74 
 
 
359 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.387144  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0964  RecJ-like exonuclease  22.59 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3426  phosphohydrolase (DHH superfamily)-like protein  23.05 
 
 
421 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1865  phosphoesterase DHHA1  25.48 
 
 
311 aa  44.3  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.955345  normal  0.780671 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3164  DHH family protein  65.71 
 
 
335 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>