45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6444 on replicon NC_010518
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010518  Mrad2831_6444    100 
 
 
507 bp  1005    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  81.76 
 
 
1122 bp  252  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4694  hypothetical protein  82.48 
 
 
1014 bp  139  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8357  putative transposase  80.99 
 
 
1071 bp  117  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  80.61 
 
 
1080 bp  117  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  80.66 
 
 
1101 bp  109  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3014  hypothetical protein  86.79 
 
 
936 bp  99.6  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3358    85.58 
 
 
1046 bp  87.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2853    84.35 
 
 
507 bp  85.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5437  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  80.63 
 
 
903 bp  85.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218978  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  85.11 
 
 
1095 bp  75.8  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6301    81.08 
 
 
674 bp  71.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4619    84.04 
 
 
549 bp  67.9  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.483735  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  81.67 
 
 
1095 bp  63.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  81.67 
 
 
1095 bp  63.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  81.67 
 
 
1095 bp  63.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  81.67 
 
 
1095 bp  63.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  81.67 
 
 
1095 bp  63.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  81.67 
 
 
1095 bp  63.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  81.67 
 
 
1095 bp  63.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  81.67 
 
 
1095 bp  63.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  81.67 
 
 
1095 bp  63.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  92.68 
 
 
1074 bp  58  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  92.68 
 
 
1074 bp  58  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  92.68 
 
 
1074 bp  58  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1306    92.68 
 
 
1075 bp  58  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  92.68 
 
 
1074 bp  58  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  92.68 
 
 
1074 bp  58  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00651  isrso5-transposase protein  94.44 
 
 
729 bp  56  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  92.11 
 
 
1089 bp  52  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  87.76 
 
 
1086 bp  50.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0513  transposase  86.79 
 
 
864 bp  50.1  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0493    86.79 
 
 
1077 bp  50.1  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  87.76 
 
 
1086 bp  50.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0765    93.75 
 
 
1113 bp  48.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.655086  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  88.64 
 
 
1092 bp  48.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  88.64 
 
 
1092 bp  48.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  88.64 
 
 
1092 bp  48.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0450  remnant of ISRSO5-transposase protein  88.64 
 
 
540 bp  48.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.681921  normal  0.284705 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  88.64 
 
 
1092 bp  48.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  88.64 
 
 
1092 bp  48.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  88.64 
 
 
1092 bp  48.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  88.64 
 
 
1092 bp  48.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  88.64 
 
 
1092 bp  48.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3888    81.05 
 
 
565 bp  46.1  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>