27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4619 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4619    100 
 
 		 549 bp  1088    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.483735  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  99.82 
 
 		 1095 bp  1076    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  88.46 
 
 		 1095 bp  583  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  88.46 
 
 		 1095 bp  583  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  88.46 
 
 		 1095 bp  583  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  88.46 
 
 		 1095 bp  583  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  88.46 
 
 		 1095 bp  583  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  88.46 
 
 		 1095 bp  583  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  88.46 
 
 		 1095 bp  583  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  88.46 
 
 		 1095 bp  583  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  88.46 
 
 		 1095 bp  583  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3014  hypothetical protein  95.09 
 
 		 936 bp  543  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5437  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  82.09 
 
 		 903 bp  135  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  80.28 
 
 		 1101 bp  133  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3888    84.08 
 
 		 565 bp  129  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599643  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0513  transposase  85.23 
 
 		 864 bp  121  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0493    85.23 
 
 		 1077 bp  121  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  80.87 
 
 		 1080 bp  107  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  80.65 
 
 		 1122 bp  97.6  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0986    85.86 
 
 		 681 bp  85.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8357  putative transposase  88 
 
 		 1071 bp  77.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4694  hypothetical protein  83.19 
 
 		 1014 bp  73.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  88.89 
 
 		 1092 bp  69.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6444    84.04 
 
 		 507 bp  67.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3358    90.38 
 
 		 1046 bp  63.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  90 
 
 		 1128 bp  48.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  93.75 
 
 		 1140 bp  48.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>