36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4961 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4961  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  836    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000421894 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1708  protein of unknown function DUF264  74.29 
 
 
421 aa  569  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  0.0322658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1430  protein of unknown function DUF264  76.14 
 
 
421 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.396368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1434  hypothetical protein  72.96 
 
 
458 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3147  hypothetical protein  67.07 
 
 
416 aa  514  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284595  normal  0.0189351 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1408  hypothetical protein  64.05 
 
 
422 aa  504  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1160  hypothetical protein  63.61 
 
 
422 aa  498  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375561  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3490  hypothetical protein  62.29 
 
 
423 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3472  hypothetical protein  65.9 
 
 
431 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1800  hypothetical protein  62.44 
 
 
423 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1964  hypothetical protein  65.63 
 
 
386 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.817651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2102  protein of unknown function DUF264  65.12 
 
 
386 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000296249  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0585  terminase large subunit, putative  61.3 
 
 
384 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1976  hypothetical protein  64.5 
 
 
370 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.493623  normal  0.545091 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0586  putative terminase large subunit  60.52 
 
 
380 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1330  large terminase  55.06 
 
 
459 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0902  hypothetical protein  55.87 
 
 
448 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.225304 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3704  hypothetical protein  52.1 
 
 
446 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2178  hypothetical protein  50.23 
 
 
452 aa  378  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1074  hypothetical protein  53.4 
 
 
414 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541704  normal  0.984253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1631  hypothetical protein  49.31 
 
 
483 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576046  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2902  hypothetical protein  50.95 
 
 
463 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176162  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1057  hypothetical protein  51.94 
 
 
425 aa  368  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0533808 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2467  putative large terminase  52.91 
 
 
414 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1129  hypothetical protein  52.91 
 
 
414 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0918  hypothetical protein  52.01 
 
 
450 aa  350  3e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3918  hypothetical protein  52.13 
 
 
439 aa  342  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0145321 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3118  hypothetical protein  49.88 
 
 
440 aa  326  6e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2004  hypothetical protein  49.05 
 
 
436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0120622 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3043  protein of unknown function DUF264  43.98 
 
 
435 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1896  hypothetical protein  42.22 
 
 
443 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3628  hypothetical protein  43.69 
 
 
690 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3483  hypothetical protein  33.42 
 
 
453 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2716  Phage uncharacterized protein-like  43.18 
 
 
458 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0633  hypothetical protein  37.9 
 
 
509 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0384  hypothetical protein  50.67 
 
 
426 aa  82  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.22896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>