45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4657 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4657  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  678    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4476  protein of unknown function DUF1611  83.58 
 
 
340 aa  578  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4542  hypothetical protein  81.19 
 
 
340 aa  558  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2676  hypothetical protein  83.28 
 
 
336 aa  558  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  0.475395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2903  protein of unknown function DUF1611  82.99 
 
 
336 aa  557  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2798  protein of unknown function DUF1611  82.09 
 
 
336 aa  549  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2786  protein of unknown function DUF1611  57.93 
 
 
329 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1220  protein of unknown function DUF1611  56.06 
 
 
330 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0034  hypothetical protein  54.38 
 
 
332 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2482  hypothetical protein  56.19 
 
 
333 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1770  hypothetical protein  54.98 
 
 
333 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0416  hypothetical protein  54.98 
 
 
333 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06557  hypothetical protein  53.75 
 
 
340 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3166  hypothetical protein  53.47 
 
 
333 aa  360  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1462  hypothetical protein  53.13 
 
 
346 aa  360  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204992  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000678  EBNA-1 nuclear protein  53.01 
 
 
334 aa  359  3e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1206  protein of unknown function DUF1611  50.76 
 
 
331 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356367  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3968  protein of unknown function DUF1611  52.91 
 
 
335 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0366  hypothetical protein  51.96 
 
 
333 aa  353  2.9999999999999997e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1127  hypothetical protein  53.13 
 
 
340 aa  352  4e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160448 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0149  protein of unknown function DUF1611  53.52 
 
 
335 aa  351  8e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2557  hypothetical protein  57.1 
 
 
335 aa  350  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3257  hypothetical protein  49.24 
 
 
359 aa  345  6e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.161607  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2789  hypothetical protein  49.39 
 
 
333 aa  340  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1819  hypothetical protein  49.54 
 
 
348 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2779  hypothetical protein  42.05 
 
 
348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1378  protein of unknown function DUF1611  41.26 
 
 
337 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0205  protein of unknown function DUF1611  33.75 
 
 
337 aa  171  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0593  protein of unknown function DUF1611  37.89 
 
 
340 aa  168  9e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1623  protein of unknown function DUF1611  41.03 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.631955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3511  hypothetical protein  37.99 
 
 
348 aa  162  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3589  protein of unknown function DUF1611  34.43 
 
 
348 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0838311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4403  protein of unknown function DUF1611  35.71 
 
 
343 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.654147  hitchhiker  0.000982381 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2290  protein of unknown function DUF1611  38.22 
 
 
341 aa  156  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1405  hypothetical protein  35.66 
 
 
348 aa  156  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4341  protein of unknown function DUF1611  35.06 
 
 
343 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0852  hypothetical protein  37.24 
 
 
360 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.98076  normal  0.809264 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2372  hypothetical protein  38 
 
 
349 aa  152  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0792  hypothetical protein  32.28 
 
 
365 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1538  hypothetical protein  31.63 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0130  hypothetical protein  35.41 
 
 
338 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.550989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0132  hypothetical protein  31.87 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2299  hypothetical protein  31.86 
 
 
392 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1935  protein of unknown function DUF1611  30 
 
 
354 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614904  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1833  hypothetical protein  29.66 
 
 
371 aa  86.7  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>