22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2679 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2679  hypothetical protein  100 
 
 
503 aa  962    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0387  hypothetical protein  57.32 
 
 
512 aa  481  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0311  hypothetical protein  54.3 
 
 
513 aa  463  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.353136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0355  hypothetical protein  54.1 
 
 
513 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335502  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0400  hypothetical protein  38.38 
 
 
480 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0338221  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3092  hypothetical protein  34.82 
 
 
512 aa  226  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3739  hypothetical protein  34.48 
 
 
505 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0644  hypothetical protein  31.08 
 
 
479 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426994  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5784  hypothetical protein  33.4 
 
 
468 aa  212  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1856  hypothetical protein  31.69 
 
 
479 aa  211  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1786  hypothetical protein  31.69 
 
 
479 aa  209  8e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4191  hypothetical protein  32.61 
 
 
478 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554467  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3863  hypothetical protein  33.53 
 
 
476 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00584301  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0989  hypothetical protein  30.16 
 
 
480 aa  194  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00407781  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0142  hypothetical protein  32.23 
 
 
474 aa  166  9e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000223018  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2146  hypothetical protein  32.98 
 
 
459 aa  128  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107944  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2038  hypothetical protein  26.87 
 
 
466 aa  96.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.561134  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2407  hypothetical protein  27.07 
 
 
431 aa  92.8  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1436  hypothetical protein  26.54 
 
 
448 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1010  hypothetical protein  45.65 
 
 
120 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000066035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5366  hypothetical protein  29.76 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1007  hypothetical protein  23.68 
 
 
386 aa  43.5  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.450732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>