76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5102 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5102  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  100 
 
 		 120 aa  234  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0682  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  69.64 
 
 		 139 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1674  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.21 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4835  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.36 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0954  hypothetical protein  31.53 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0333861  normal  0.110098 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2211  membrane bound protein complex subunit mbxG  35.85 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.756272  normal  0.135903 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0670  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.36 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.54 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000428364  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1215  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  29.91 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1608  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.36 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.439148  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2862  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  36.63 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2968  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.58 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12070  NADH dehydrogenase I subunit K  32.08 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000348654  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3146  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  34.86 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0270139  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0507  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  27.78 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105387  hitchhiker  0.0000332373 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1002  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40.86 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0892  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.32 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0510919  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1299  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27.52 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.11215  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2162  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  32.5 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0402  hypothetical protein  31.9 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1773  Na(+)/H(+) antiporter subunit C  31.9 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3949  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.7 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100103 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0843  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.11 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0864644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3448  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.07 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.458831  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5154  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.02 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0469  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  25.45 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2585  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  32.73 
 
 		 114 aa  50.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2711  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.27 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2285  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  28.16 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0916  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  26.73 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.259781  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0556  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27.1 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0536  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.83 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1636  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  30.1 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0562  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34.34 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.759234  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3220  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  33.33 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0485  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.78 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.374483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3952  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  25.71 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.18 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0969  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.18 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1161  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.77 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1799  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.94 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2872  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.09 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2807  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  37.23 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2342  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.95 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.556255  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0134  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.55 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1743  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  24.47 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1009  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.44 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0960292  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0866  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.73 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719007  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0742  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  34.38 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0979  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.33 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.215867  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2664  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  39.33 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3283  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  24.76 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0233642  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5268  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  33.98 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3665  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  24.76 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1770  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.25 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1057  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  28.97 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.722396  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1841  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.93 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.682129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1204  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.13 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195388  hitchhiker  0.00235096 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3186  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.53 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0868  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.73 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3659  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35.63 
 
 		 208 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0096  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.97 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.43 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.696094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0076  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  26.89 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0579  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  24.74 
 
 		 111 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1352  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.32 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.687552  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0804  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  26.53 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3872  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.33 
 
 		 212 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1282  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  35 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4786  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  25.89 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0283  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.83 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2526  NADH dehydrogenase subunit K  32.71 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1590  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.04 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.1614  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.78 
 
 		 124 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6654  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhC subunit- like protein  36.56 
 
 		 272 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  31.82 
 
 		 100 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>