25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4818 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4818  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  300  5.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal  0.143523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4669  hypothetical protein  88.08 
 
 
149 aa  228  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4300  hypothetical protein  89.4 
 
 
151 aa  201  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3985  hypothetical protein  69.5 
 
 
162 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.712541  decreased coverage  0.00103127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1064  hypothetical protein  73 
 
 
144 aa  160  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.589479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2096  hypothetical protein  75.26 
 
 
146 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0697301  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0715  hypothetical protein  44.12 
 
 
214 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.335973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1260  hypothetical protein  46.67 
 
 
125 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357949  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4016  hypothetical protein  43.81 
 
 
125 aa  103  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1477  hypothetical protein  47.17 
 
 
146 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4328  hypothetical protein  43.81 
 
 
125 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1127  hypothetical protein  42.86 
 
 
129 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  0.694402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1168  hypothetical protein  38.78 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2380  hypothetical protein  43.56 
 
 
146 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.37673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1242  hypothetical protein  43.56 
 
 
129 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1016  hypothetical protein  40.14 
 
 
148 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.586424 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2701  hypothetical protein  40.95 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0364226  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2615  hypothetical protein  43.81 
 
 
107 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0733143  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0962  hypothetical protein  43.43 
 
 
123 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0709  putative signal peptide protein  40.38 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1090  hypothetical protein  40.66 
 
 
229 aa  84  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0665  hypothetical protein  40.57 
 
 
111 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0671  hypothetical protein  40.57 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1465  hypothetical protein  39.39 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0757  hypothetical protein  27.96 
 
 
126 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>