22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4343 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4343    100 
 
 		 816 bp  1618    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0441  integrase catalytic region  85.01 
 
 		 840 bp  630  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2633  integrase catalytic region  85.01 
 
 		 840 bp  630  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2926  integrase catalytic region  85.01 
 
 		 840 bp  630  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4739  integrase catalytic region  85.01 
 
 		 840 bp  630  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6105  integrase catalytic region  85.01 
 
 		 840 bp  630  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1119    84.64 
 
 		 741 bp  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0958  integrase catalytic region  80.91 
 
 		 792 bp  319  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0232    81.88 
 
 		 320 bp  161  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0208    85.91 
 
 		 330 bp  129  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3247  integrase catalytic subunit  86.25 
 
 		 798 bp  71.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00558432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2970  integrase catalytic subunit  86.25 
 
 		 798 bp  71.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0996434 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3535  integrase catalytic subunit  86.25 
 
 		 798 bp  71.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323423  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3126  integrase catalytic subunit  86.25 
 
 		 798 bp  71.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1494  hypothetical protein  86.05 
 
 		 693 bp  67.9  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4611    83.75 
 
 		 387 bp  56  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0616505 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1659    94.29 
 
 		 240 bp  54  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  94.29 
 
 		 783 bp  54  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  94.29 
 
 		 783 bp  54  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7504  IS3 family transposase  93.94 
 
 		 858 bp  50.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3989  IS3 family transposase  93.94 
 
 		 498 bp  50.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4641    85.71 
 
 		 177 bp  48.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>